Si al desinstalar un servicio de Windows con:

miservicio /uninstall

Y al comprobar que no se desinstala el servicio, si vuelves a probar de desinstalar el servicio puede aparecerte un mensaje del estilo

System Error. Code: 1072. The specified service has been marked for deletion:

Parece ser que se marco para desinstalar y no se desinstala.

Prueba estas tres cosas:

1. Para el servicio de este modo

  net stop "nombre del servicio"

2. Asegurate de cerrar Microsoft Management Console (mmc.exe) y si es necesario mata el proceso con:

  taskkill /F /IM mmc.exe

3. Elimina el servicio con

  sc delete "nombre del servicio"

Si aun así el servicio no se desinstala, prueba a cerrar la sesión y vuelve a entrar. Sino hay manera, no te quedará mas remedio que reiniciar el servidor.