Gracias a este artículo, dejo aquí una serie de herramientas de .Net Framework que pueden sacar de un apuro:

Herramienta Registro de IIS en ASP.NET (Aspnet_regiis.exe)
Herramienta Registro de SQL Server para ASP.NET (Aspnet_regsql.exe)
Herramienta de compilación de ASP.NET (Aspnet_compiler.exe)
Herramienta de comprobación de certificados (Chktrust.exe)
Desensamblador de MSIL (Ildasm.exe)
Ensamblador de MSIL (Ilasm.exe)
Herramienta Installer (Installutil.exe)

Una mención a Ildasm.exe: útil si quieres ver los metadatos de una dll o exe con código administrado, ver sus dependencias o chafardear el msil del mismo. El ejecutable se encuentra dentro del SDK de Visual Studio y no en el SDK del propio .NET Framework:

Archivos de programa\Microsoft Visual Studio .NET 2003\SDK\v1.1\Bin\ildasm.exe
Archivos de programa\Microsoft Visual Studio 8\SDK\v2.0\Bin\ ildasm.exe

Un artículo explicativo en la Web del Guille.